Von Braun sa narodil ako syn starej pruskej šľachtickej rodiny ako druhé dieťa baróna Magnusa von Brauna. Barón bol znamenitým poľnohospodárskym expertom, čo bolo takmer samozrejmosťou pri značnej rozlohe jeho poľnohospodárskych majetkov a preto by sa dalo takmer samozrejme očakávať, že jeho syn Wernher bude buď pokračovať v šľapajach svojho otca, alebo, ako to bolo zvykom v podobných prípadoch, bude sa uchádzať o miesto úradníka vo.vyšších vládnych kruhoch. Jeho osud sa však mal odvíjať úplne inakšie a úplne proti predstavám jeho barónskeho otca.